Если у вашего файла расширение *.MSI, то он был запакован при помощи Windows Installer. Эти файлы можно устанавливать с ключами /qb и /qn. Вкратце, /qb и /qn аналогичны. Первый покажет прогресс установки, а второй полностью скроет все окна и незаметно установит приложение. Если вы хотите отобразить прогресс установки, но не показывать кнопку Cancel, исключая возможность прерывания установки пользователем, то используйте ключ /qb-!.
Некоторые приложения требуют перезагрузки компьютера после установки. Чтобы этого избежать используйте свойство REBOOT=ReallySuppress вместе с /qn или /qb, заключая все выражение в кавычки. Например:
setup.msi "/qn REBOOT=ReallySuppress"
Подробнее о ключах Windows Installer можно почитать в этой статье MSDN.