Для создания индекса (закладка Index в навигационной панели скомпилированного файла) я использовал ключевые слова, которые были заранее подготовлены и внесены мною в код HTML файлов. Где-то в тексте справки к HTML Help Workshop мне встретилась фраза, что пользователи чаще обращаются к индексу, чем к поиску. Не знаю насколько это верно, но мне вообще хотелось иметь индекс, чтобы было все профессионально :) К сожалению, я так и не выяснил, как автоматизировать процесс, поэтому эта часть работы потребовала ручной правки каждой статьи. Добавить ключевые слова для индекса в каждую страницу можно через интерфейс HTML Help Workshop или вручную. Я предпочел второй путь.
В код HTML страницы после тега BODY вносится следющий текст (приводится скриншот, т.к. данный HTML код вырезается скриптом сайта):
Непроизносимый набором символов лучше скопировать :) Вообще, это одна строка, просто на скриншоте сделан перевод строки.
object type="application/x-oleobject" classid="clsid:1e2a7bd0-dab9-11d0-b93a-00c04fc99f9e"
Очевидно, что можно указать несколько ключевых слов - они все будут указывать на статью, в текст которой они были внесены. В итоге я методом Search&Replace внес эту абракадабру во все страницы, а потом потихоньку добавлял ключевые слова. Если вам известен более простой способ, то я буду рад о нем узнать.